本领域设在食品科技学院，授予农业推广硕士学位。
现有博士生导师3人，硕士生导师26人；国家现代农业产业技术体系建设岗位科学家2人；著名食品专家孙宝国院士为本学科双聘院士。拥有“广东省水产品加工与安全重点实验室”、“农业部“国家贝类加工技术研发专业分中心”、“水产品深加工广东普通高校重点实验室”和“广东省高等学校海洋食品学实验教学示范中心”等4个省（部）级科研与教学平台；实验室面积达到10000m2，仪器设备总价值3000余万元。近5年，承担各类课题150余项，其中国家级30余项，省（部）级80余项；到账经费5000余万元；发表学术论文600余篇，其中SCI/EI收录100余篇；出版专著4部，获国家授权专利40余项；获省（部）级及以上教学与科学技术奖8项，其中国家科技进步二等奖1项；科研成果转化成效显著。食品工程专业硕士点设有3个研究方向：
①、水产品加工工程：以南海水产资源为原料，针对水产品加工企业中存在的工程化问题，开展水产品食品化学特性、保鲜与加工工程技术、加工副产物综合利用、海洋生物活性物质研究与开发等方面的研究，为南海区乃至全国水产品加工业的健康发展提供重要的技术支撑。
②、农产品加工工程：以亚热带特色农产品为原料，针对农产品加工企业中存在的工程化问题，开展果蔬采后贮藏保鲜、贮藏与加工工程技术、加工副产物综合利用等方面的研究，为食品加工企业提供技术支撑。
③、食品质量与安全：围绕食品产业链中质量与安全关键科学与技术问题，重点开展有害因子的识别、发生、残留规律、快速检测与风险分析和预警以及质量安全控制体系等方面的研究，为食品加工企业的安全生产提供技术支撑。
